El PUAS es uno de los cinco programas de la Coordinación de la Investigación Científica, a través de los cuales la UNAM articula las capacidades universitarias en conocimiento, desarrollo tecnológico e innovación,  para atender temas de interés nacional y de impacto social. 

Para lograr su misión y cumplir con sus objetivos de creación, el PUAS se apoya en un Comité Directivo y en un Consejo Consultivo.

El Comité Directivo, presidido por la titular de la Coordinación de la Investigación Científica, está formado por las direcciones de:

1.  Las Facultades de Ciencias, Medicina, Medicina Veterinaria y Zootecnia, Química y de Estudios Superiores Cuautitlán.

2. Las Escuelas Nacionales de Estudios Superiores, Unidades León, Morelia y Mérida.

3. Los Institutos de Biología, Ciencias del Mar y Limnología, Ecología, de Investigaciones en Ecosistemas y Sustentabilidad, Ciencias del Mar y Limnología, Investigaciones Sociales e Investigaciones Económicas. 

Por su parte, el Consejo Consultivo está conformado por profesionistas de reconocida trayectoria pertenecientes a la academia, gobierno, asociaciones de productores, asociaciones de especialistas, cadenas de distribución alimentaria y organizaciones de la sociedad civil.